我协商离职，不愿意中断就业，现在申请失业金

您提到公司未按照您的意愿中断就业，这确实可能涉及劳动法相关规定。《劳动合同法》规定，劳动合同的解除应遵循双方协商一致的原则。若公司单方面违背您的意愿中断就业，可能构成违法解除劳动合同。在此情况下，您有权要求公司纠正其违法行为，或寻求劳动仲裁委员会或法院的帮助，维护自己的合法权益。法律依据为《劳动合同法》第三十六条关于协商一致解除劳动合同的规定。
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若公司不配合修改中断就业原因，影响您申请失业金卡，您可采取以下措施：1.收集证据，包括与公司沟通的记录、劳动合同等，证明公司未按照您的意愿中断就业；2.向劳动仲裁委员会提起仲裁，要求公司配合修改；3.如仲裁无果，可向法院提起诉讼。同时，您也可以咨询当地劳动部门，了解具体的失业金申请流程和要求。
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从法律角度，您应先与公司进行沟通，明确表达您的意愿和要求，并保留沟通记录。若公司仍不配合，您可向当地劳动仲裁委员会提起仲裁，要求公司履行法定义务，配合修改中断就业原因。同时，考虑咨询专业律师，获取更具体的法律建议和支持。在必要时，也可向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。